كلما كان الختان مبكراً، كلما كان أفضل. يقول الأطباء إن الوقت المثالي لختان مولودك يكون بين 24 إلى 72 ساعة بعد الولادة. سيكون مولودك الجديد أقل ميلاً للنزيف وضعفاً تجاهه. لذا، سيكون أقل اهتياجاً وحركة أو انزعاجاً أثناء العملية. يختار بعض الأهل تأجيل عملية ختان أطفالهم إلى فترة أبعد كثيراً في حياتهم، لكن يجد الأطباء أن خطر حاجة الطفل إلى القطب أو الغرز لوقف النزيف يزيد مع العمر. كما يعتقد بعض الناس أن الأطفال فوق سنّ الأسبوعين يكونون أكثر وعياً بالانزعاج الذي يحدث لهم بسبب عملية الختان.  يجب أن تتم عملية الختان تحت تأثير التخدير العام للأطفال بعد سنّ الثلاثة أشهر. بينما يكبر طفلك، ترتفع فرصة إحساسه بالألم وتذكر الوضع. هناك بعض الحالات الطبية التي تمنع إجراء الختان. عليك التروي والانتظار قبل ختان طفلك في حال كان:  ١-لا يشعر بأنه على ما يرام أو أنه مريض مع حرارة مرتفعةوتقيؤ وغيرها من الأعراض ٢-مولوداً قبل الأوان أي خديجاً أو مبتسراً ٣-لديه عيوباً تتعلق بالعضو التناسلي (مثل هيبوسبيديس، وهي حالة يكون فيها موضع فتحة مجرى البول غير طبيعي) ٤-لديه مشاكل نزيف، إذا كان لديك تاريخ عائلي من أمراض تتعلق بالنزيف، فيجب أن يفحص الطبيب طفلك ليتأكد من أنه لم يرث المرض.